En agosto del 2006, Lehmann reveló que durante el Mundial había estado sufriendo de una lesión en el tobillo, la cual él afirmaba era resultado de utilizar diferentes zapatos a los que regularmente usaba en su club. Debutó por primera vez en Primera División, el 31 de agosto de 1998 contra el Real Madrid en el Santiago Bernabéu, cayendo por un marcador de 4-1. Aun así, el Villarreal (al mando de José Antonio Irulegui) tuvo una buena primera vuelta de campeonato, camiseta dortmund destacando los triunfos sobre el U. D. Salamanca por 5-0 en El Madrigal y sobre el F. C. Barcelona de Louis Van Gaal (1-3 en el Camp Nou).