En la temporada 1988/89 los “Fohlenelf” quedaron en sexta posición. Al finalizar la fase de grupos quedó en segunda posición del grupo, solo por detrás del equipo Turco Fenerbahçe, por lo que se clasificó para los dieciseisavos de final en los que se enfrentó a SS Lazio empatando en el partido de ida en el Borussia Park y cayendo en Roma. Las próximas temporadas el equipo se mantendrá en mitad de tabla.