Miguel Mostto fue nuevamente el goleador del Descentralizado 2006 con 22 goles. El partido de ida, jugado en el Garcilaso de la Vega, lo ganó Cienciano 1-0. Sin embargo, el partido de vuelta jugado en Matute lo perdió 3-1, camisetas de futbol baratas quedándose con el subtítulo por diferencia de goles. En el partido de vuelta, en el mítico estadio Maracaná de Río de Janeiro, perdió 1-0 con un tanto de Romário, el Balón de Oro de la última Copa del Mundo.