El Deportivo es uno de los nueve clubes que se han proclamado campeones del Campeonato Nacional de Liga de Primera División, título conquistado en la última temporada del siglo XX, la 1999-2000. Ha logrado además cinco subcampeonatos y ocupa el duodécimo puesto histórico. Fundación VCF al no estar de acuerdo con algunas de las bases propuestas, como que el club tuviera un voto exactamente igual que Bankia y la Fundación VCF.